生信技能|Graphpad作图，这些技巧你知道吗？
The following article is from 小张聊科研 Author 风行者
药学相关研究论文中有不少计算药物半抑制浓度IC50的拟合曲线图，可是你知道这种图该怎么做吗？
今天笔者给大家分享一下这种拟合曲线图的作图方法。
我使用的作图工具是Graphpad Prism 6，打开软件后，选择XY作图方式。
将实验所得的数据填写入图表中注意x轴写入的是log[药物]，比如说你加入的药物浓度分别为1-100000nM，那首先你必须先将这个浓度进行换算，一个有效的方法就是在Excel中进行计算，通过log[浓度]获得对于的对数值，如图所示换算为0-5.
将换算值填入Graphpad Prism 6，Y轴为你实验所测活性。
填入数值后，点击date1即可看到如下点状图。
接下来点击analysis栏目中中间那个非线性回归曲线，上图红色圈中图标。
进入后，可以看到有多种非线性回归曲线方式，由于我们做的是半抑制浓度IC50，因此选择inhibition这一栏，应用后，可以看到图像中出现了一条曲线。
点击左方的results栏目即可获得此药物的IC50=58.04nM。
学会了吗，小伙伴们，你们也可以用这种方法来试试半活化浓度EC50。如下图所示填入XY轴数值。
随后同样点击非线性回归曲线
进入后，选择stimulation这一栏，应用后，即可获得活化曲线图。
点击results获得EC50=1723nM。
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